실시간 중합효소연쇄반응검사와 아가로오스겔 전기영동에 의한 중합효소연쇄반응물의 정량검사 비교

초록

배경 : 최근 PCR의 매 주기마다 증폭산물을 측정하는 실시간(real-time) PCR 방법이 도입되어, 증폭산물을 정확하게 분석하게 되었다. 그러나 실시간 중합효소연쇄반응 검사 도입과 검사 수행시 사용하여야 하는 전용 시약과 소모품의 구입에 많은 비용이필요하므로, 실시간 중합효소연쇄반응 검사 장비가 없는 실험실에서의 사용이 제한적이다. 이에 본 연구에서는 기존의 끝점 PCR을사용하여 전기영동과 브롬화에티듐(EtBr) 염색만으로 신뢰할 수있는 유전자 발현 연구를 수행할 수 있는지를 실시간 중합효소연쇄반응 검사법과의 비교분석을 통하여 평가하고자 하였다. 방법 : 실시간 중합효소연쇄반응 검사를 시행하여 얻은 정량값과 실시간 중합효소연쇄반응 검사 후의 끝점 PCR 산물을 아가로오스겔에 전기영동한 후 브롬화에티듐으로 염색하고 자외선 투시하에서 방출되는 형광강도를 측정하여 정량한 결과로 각각 MMP-1 유전자의 상대정량을 시행하여 비교하였다. 결과 : 실시간 중합효소연쇄반응 검사와 끝점 PCR 산물의 아가로오스겔 전기영동에 의한 MMP-1 유전자의 상대정량 값은 상관계수가 r=0.16 ( P<0.01)으로 매우 낮은상관관계를 나타내었다.